Советуем для ознакомления:

Лаборатория:

Популярные разделы сайта:

Реассоциация ДНК. Числовая таксономия

Метод реассоциации ДНК позволяет судить о близком родстве по способности денатурированных отдельных нитей ДНК одних бактерий реассоциировать перекрестно при инкубации в определенных условиях с нитями ДНК других, образовывая спиральную гибридную молекулу. Метод гибридизации ДНК с ДНК также имеет относительные пределы точности, так как часть оснований в образовавшихся гибридных ДНК оказывается ложноспаренными. Кроме того, степень гомологии ДНК может существенно изменяться в зависимости от условий эксперимента [Блохина И. Н., Лева-нова Г. Ф., 1976; Nester E. et al., 1978; Bredley S., 1980].
Применяют и другие методы геносистематики [Петровская В. Г., 1982].

Числовая таксономия — чисто математический метод классификации, где устанавливается родство между какими-либо группами бактерий по определению сходства многочисленных характеристик. Метод стал доступным для исследователей с развитием компьютерной техники. В нумерической таксономии основной принцип иметь достаточное число признаков. По мнению одних ученых, ценность признаков не имеет значения, тогда как другие считают отдельные свойства сравнительно более весомыми.

При испытании большого числа штаммов бактерий в многочисленном ряде тестов применяют программу ЭВМ для калькуляции коэффициента сходства каждой пары микроорганизмов и для составления на этой основе матрицы сходства (дендрограммы). Те, что имеют более 90% сходства, обозначают как единый вид; другие, более отличающиеся, классифицируют как разные виды, на уровне 70% сходства образующие род.

реассоциация днк

Однако еще не решено — какой процент сходства должен быть выбран, чтобы показать родство бактерий на уровне вида и рода? Для всех ли групп бактерий он одинаков? Как много и какие тесты должны быть избраны для таксономического эксперимента? и т. д. Поэтому в настоящее время таксономисты считают, что наиболее эффективным является сочетание методов геносистематики и числовой таксономии с классическим, основанным на определении морфологии, ферментативных свойств и антигенной структуры бактерий.

В «Определителе бактерий Берги» (1974) использованы результаты исследований энтеробактерий методом установления гомологии по нуклеотидному составу ДНК (процент содержания Г+Ц), являющегося, как >же было сказано, одним из относительно эффективных методов геносистематики. Содержание Г+Ц в ДНК энтеробактерий установлено в пределах 39—59%.

«Определитель бактерий Берги» последнего издания получил широкое международное признание. На этом основании настоящее руководство базируется на классификации и номенклатуре энтеробактерий по Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (1974). Помимо этого полного издания, был составлен его сокращенный вариант, опубликованный в СССР на русском языке — «Краткий определитель бактерий Берги» (1980).

- Читать далее "Классификаций энтеробактерий. Виды энтеробактерий"

Оглавление темы "Энтеробактерии и их диагностика":
1. Энтеробактерии. ДНК и генетика энтеробактерий
2. Реассоциация ДНК. Числовая таксономия
3. Классификаций энтеробактерий. Виды энтеробактерий
4. Проблемы классификации энтеробактерий. Принципы бактериологического исследования
5. Материал для бактериологического исследования. Забор материала для бакпосева
6. Кровь для бактериологического исследования. Бактериологический посев желчи, мочи, гноя
7. Бакпосев спинномозговой жидкости, операционного материала. Бактериологическое исследование мокроты, трупа
8. Выделение энтеробактерий. Идентификация энтеробактерий
9. Накопление энтеробактерий. Плотные питательные среды
10. Посев на плотные питательные среды. Селенитовые питательные среды