Современный взгляд на происхождение ВИЧ
После исследования вариаций последовательности нуклеотидов между тремя группами ВИЧ-1 и различными их субтипами некоторые ученые предположили, что ВИЧ-1 проник в человеческую популяцию от приматов всего лишь 30-100 лет назад.
Анализ генетического сходства, особенно исследование полных последовательностей нуклеотидов в области генома, кодирующей белки оболочек вирусов на филогенетическом дереве, показал, что субтип В попал в Соединенные Штаты, по-видимому, в 1967 г. (обзоры см. в 2282 и 3747), а субтип С появился в Африке в середине или в конце 1960-х г.г..
Многие исследователи продолжают попытки выяснить раннее происхождение вируса и указывают на то, что вирус мог появиться в человеческой популяции еще раньше. В связи с этим некоторые исследования «молекулярных часов» указывают на возможность появления общего предка ВИЧ-1 группы М и обезьяньего вируса SIV в конце XVII в..
Важно отметить, что до сих пор неизвестно, какая группа или субтип ВИЧ-1 первоначально проник в человеческую популяцию, однако есть данные, что группа О11 появилась в ней очень рано.
Как отмечали выше, самое раннее документальное свидетельство ВИЧ-инфицирования человека было получено при исследовании на противовирусные антитела образца сыворотки из Африки, выделенного в 1959 г. в Конго. Последовательность нуклеотидов этого вируса позволяет отнести его к предковому варианту субтипов В и D.
Также важно отметить, что последовательности нуклеотидов генома вируса, выделенного из образцов крови норвежской семьи, инфицированной ВИЧ в середине 1960-х гг., были похожи на нуклеотидные последовательности геномов циркулирующих в настоящее время вирусов группы О. Отец этой семьи путешествовал по Африке. Эти данные, по-видимому, отражают эволюционные свойства вирусов группы О. Однако в других образцах, полученных из различных регионов Африки до середины 1970-х гг., не обнаружили серологических признаков ВИЧ-инфекции.
Поэтому не до конца ясно, как, когда и где ВИЧ появился в человеческой популяции и какие из современных групп и субтипов больше других напоминают предковый вирус.
но ВИЧ-2, который встречается реже, до сих пор обнаруживается в Западной Африке и совсем недавно был найден в Индии, и его частота нарастает.
Распространение различных субтипов ВИЧ-1 обозначено буквами. Распространение отдельных групп ВИЧ-2 не указано.
Существование субтипов может отражать сильную гетерогенность ВИЧ-1 и ВИЧ-2, которая является результатом высокой скорости мутагенеза, вызванного высокой частотой «ошибок» при работе вирусной обратной транскриптазы, а также способности вируса к быстрой репликации (цикл около 24 часов) и, соответственно, огромному числу дочерних вирионов (до 1000 вирионов на клетку за 1 цикл).
Рекомбинация вирусов также может быть одним из основных механизмов образования новых субтипов и, как отмечали выше, именно рекомбинации явились причиной образования ранее считавшихся субтипами варианты Е и I. Вероятно, размножение и распространение вирусов в пределах одного географического региона после нескольких трансмиссий и селекции под давлением противовирусных механизмов в организмах нескольких хозяев может привести к отбору существенных мутаций и образованию отдельного субтипа.
Способность вируса к быстрой репликации, безусловно, влияет на его вариабельность и существование множества вариантов, встречающихся у разных пациентов и являющихся результатом передачи субтипов вируса между народами, населяющими планету. Как отмечали выше, высокое разнообразие отражает более длительное время нахождения вируса в популяции.
Заслуживает внимания тот факт, что изучение изолятов вируса, циркулирующих в Демократической Республике Конго (ранее Заир) в 1980-х гг., показало, что до 37% штаммов даже в то время представляли собой рекомбинантные формы вирусов. Было документировано множество случаев немоноинфицирования. Результаты показали, что в начале 1980-х гг. в Центральной Африке уже развилась серьезная эпидемия ВИЧ.
Разнообразие вирусов, найденных там в тот период, было большим, чем обнаруживающееся в настоящее время в других регионах планеты. Эти данные вызывают вопрос: являются ли субтипы, циркулирующие в настоящее время, результатом собственной эволюции ВИЧ группы М или рекомбинантными вирусами?
Также любопытно, что сохраняется относительное постоянство распределения групп и субтипов вирусов по планете. Например, в Северной Америке встречается очень небольшое число людей, инфицированных вирусами, не относящимися к субтипу В, что вызывает вопрос об исключительности появления некоторых субтипов вирусов в других странах. Обнаружение вирусов ВИЧ-1 групп N и О преимущественно в Камеруне и преобладание некоторых субтипов в определенных регионах, например в Румынии (F) и в России (G), отражают такой характер распространения.
Неизвестно, можно ли объяснить эти данные virus founder эффектом.
Др. Монтанье (соучредитель Всемирного фонда исследований и профилактики СПИДа и содиректор Программы международного вирусного сотрудничества.
Директор по научной работе Национального центра научных исследований [CNRS] Франции), др.
Шерманн (Главный директор по научной работе Urrma Biopharma в Монреале, Канада, и директор по научной работе и развитию URRMA R&D, Обань, Франция) и др.
Барр-Синусси (директор лаборатории по изучению ретровирусных инфекций, Институт Пастера, Париж) стали первыми учеными, выделившими ВИЧ.
Вирус был выделен у пациента с синдромом лимфоаденопатии.
Первоначально вирус получил название LAV (вирус, вызывающий лимфоаденопатию), затем было доказано, что он является причиной развития СПИДа.
- Читать "Теории происхождения ВИЧ-1"
Оглавление темы "Открытие и происхождение ВИЧ":