Группы и субтипы ВИЧ-2 - изменчивость

К настоящему времени идентифицировали (по различиям нуклеотидных последовательностей) восемь групп ВИЧ-2 (от А до Н). Группы А и В к настоящему времени являются наиболее часто встречающимися.

ВИЧ-2 группы А чаще всего обнаруживают в Сенегале и Гвинее-Бисау; группа В встречают в государстве Берег Слоновой Кости (Ivory Coast). В других группах было выделено только по одному образцу.

Группа G была выделена из образца крови, полученного с Берега Слоновой Кости, а группы С, D, Е и F были найдены в сельских областях Сьерра-Леоне и Либерии.

Группа D также, по-видимому, имеет тесное родство с изолятами SIVsmm (SIVsooty mangabeys), выделенными у обезьян черных мангобеев, живущих в тех же областях.

В пользу этого говорит и сходство LTR ВИЧ-2 с таковыми у SIV, и наличие в этих длинных концевых повторах только одного сайта связывания фактора транскрипции NF-kB.

Распространенность групп и субтипов ВИЧ
ВИЧ-1 является основным типом ВИЧ, распространенным по всему миру,
но ВИЧ-2, который встречается реже, до сих пор обнаруживается в Западной Африке и совсем недавно был найден в Индии, и его частота нарастает.
Распространение различных субтипов ВИЧ-1 обозначено буквами. Распространение отдельных групп ВИЧ-2 не указано.
Филогенетическое дерево соотношения ВИЧ-2 и SIV
Бескорневое филогенетическое дерево, показывающее соотношение групп ВИЧ-2 и типичных представителей SIVsm, составленное на основании выстраивания полного генома по методу максимального правдоподобия.
Цифры возле узлов представляют процент усовершенствованных репликатов, поддерживающих субтип. Показаны значения, превышающие 70%.
Шкала показывает количество замещений на один сайт и отражается в длине ветвей.

- Читать "Особенности биологии группы, субтипов вирусов ВИЧ"

Оглавление темы "ВИЧ":
  1. Принципы организации генома ВИЧ
  2. Изменчивость вируса ВИЧ и его гетерогенность
  3. Группы и субтипы ВИЧ-1 - изменчивость
  4. Группы и субтипы ВИЧ-2 - изменчивость
  5. Особенности биологии группы, субтипов вирусов ВИЧ
Все размещенные статьи преследуют образовательную цель и предназначены для лиц имеющих базовые знания в области медицины.
Без консультации лечащего врача нельзя применять на практике любой изложенный в статье факт.
Жалобы и возникшие вопросы просим присылать на адрес statii@dommedika.com
На этот же адрес ждем запросы на координаты авторов статей - быстро их предоставим.