Группы и субтипы ВИЧ-2 - изменчивость
К настоящему времени идентифицировали (по различиям нуклеотидных последовательностей) восемь групп ВИЧ-2 (от А до Н). Группы А и В к настоящему времени являются наиболее часто встречающимися.
ВИЧ-2 группы А чаще всего обнаруживают в Сенегале и Гвинее-Бисау; группа В встречают в государстве Берег Слоновой Кости (Ivory Coast). В других группах было выделено только по одному образцу.
Группа G была выделена из образца крови, полученного с Берега Слоновой Кости, а группы С, D, Е и F были найдены в сельских областях Сьерра-Леоне и Либерии.
Группа D также, по-видимому, имеет тесное родство с изолятами SIVsmm (SIVsooty mangabeys), выделенными у обезьян черных мангобеев, живущих в тех же областях.
В пользу этого говорит и сходство LTR ВИЧ-2 с таковыми у SIV, и наличие в этих длинных концевых повторах только одного сайта связывания фактора транскрипции NF-kB.
но ВИЧ-2, который встречается реже, до сих пор обнаруживается в Западной Африке и совсем недавно был найден в Индии, и его частота нарастает.
Распространение различных субтипов ВИЧ-1 обозначено буквами. Распространение отдельных групп ВИЧ-2 не указано.
Цифры возле узлов представляют процент усовершенствованных репликатов, поддерживающих субтип. Показаны значения, превышающие 70%.
Шкала показывает количество замещений на один сайт и отражается в длине ветвей.
- Читать "Особенности биологии группы, субтипов вирусов ВИЧ"
Оглавление темы "ВИЧ":