Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Для химиотерапевтов, клиницистов и эпидемиологов наиболее важное значение имеют данные, получаемые при проведении эпидемиологического анализа.
Эпидемиологический раздел программы предназначен для постоянного мониторирования микрофлоры, вызывающей воспалительные и гнойно-септические заболевания и осложнения, слежения за уровнем резистентности выделенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам, а также для выявления штаммов, подозрительных на госпитальные, с использованием для их поиска признака полирезистентности к антибактериальным препаратам.
Данный раздел программы предусматривает проведение анализа и обработки той же базы данных, что и при составлении статистического отчета, и включает следующие разделы:
— спектр микроорганизмов
— чувствительность микроорганизмов
— активность антибиотиков
— состав ассоциаций
— полирезистентные штаммы.
Расчет показателей при проведении эпидемиологического анализа отличается от статистического отчета рядом особенностей. Так, в разделе «Спектр микроорганизмов» исключаются одинаковые микроорганизмы, выделенные от одного больного при повторных исследованиях, в разделе «Состав ассоциаций» — повторные высевы одинаковых по составу ассоциаций у одних и тех же больных, в разделах «Чувствительность микроорганизмов» и «Активность антибиотиков» — одинаковые по чувствительности одноименные микроорганизмы у одного больного при повторных исследованиях.
Кроме того, при проведении эпидемиологического анализа предусматривается возможность отбора анализов, удовлетворяющих данным таблиц при расчете всех показателей. Например, в разделе «Спектр микроорганизмов» можно выбрать списки больных (с указанием номера анализа, Ф. И. О. даты поступления материала на исследование, отделения, биоматериала, диагноза), у которых выделены интересующие пользователя микроорганизмы. Отобранный список появляется в нижней части соответствующего эпидемиологического отчета. Он может содержать большее число отобранных анализов по сравнению с соответствующим количественным показателем таблицы, так как для большей достоверности данных список включает исследования с повторными высевами одноименных микроорганизмов у одних и тех же больных.
а) Спектр микроорганизмов. Спектр микроорганизмов — это упорядоченный по частоте встречаемости (в абсолютных цифрах и в процентах по отношению ко всем выделенным) список микроорганизмов, выделенных в целом по стационару или выбранных отделениях, диагнозах, биоматериалах за весь или за указанный период, т. е. исходя из параметров, заложенных в отчетах. Спектр микроорганизмов представляется за весь указанный период и в динамике по месяцам в пределах выбранного периода.
Отчет представлен в виде таблицы, в левой части которой помещены названия микроорганизмов с количеством выделенных штаммов за отчетный период, в правой — динамика выделения каждого микроорганизма по месяцам.
В данном отчете, в отличие от статистического отчета «Микроорганизмы», в число культур не вошли одноименные микроорганизмы, полученные от одного и того же больного при повторных высевах.
Так, в приведенных выше данных статистического отчета количество выделенных микроорганизмов составляет 2412, а при анализе спектра выделенных микроорганизмов в эпидемиологическом отчете — 2189. Подчеркиваем, что исключение повторных высевов одних и тех же микроорганизмов от одного больного позволяет получать истинные данные о ведущей флоре. Выходные данные в данном разделе отчета пользователь может получать на любом уровне классификации микроорганизмов (вид, род, группа микроорганизмов).
Сведения по ведущей микрофлоре (8-16 наиболее часто встречающихся микроорганизмов, составляющих от 70 до 90% от всех выделенных) можно получить в графическом варианте.
В графическом варианте можно представить и динамику ведущей микрофлоры за любой выбранный период времени.
Сведения о ведущей микрофлоре уникальны не только для каждого региона, стационара, но и для каждого отделения в пределах одного лечебного учреждения.
б) Чувствительность микроорганизмов. Результат — упорядоченный по количеству чувствительных штаммов (в абсолютных цифрах и в процентах к числу исследованных культур) список антибиотиков для каждого микроорганизма либо групп или подгрупп микроорганизмов в целом за указанный период и в динамике по месяцам.
Результат — данные по чувствительности микроорганизмов каждого вида (рода, группы или подгруппы) из спектра в абсолютных цифрах и в процентах к количеству исследованных культур (S, I и R штаммов) к различным антибиотикам, перечень которых для каждого наименования упорядочен по числу чувствительных штаммов, в целом за указанный период и в динамике по месяцам.
Отчет представлен в виде таблицы, в левой части которой даны названия микроорганизмов, в правой — перечень антибиотиков, изученных в отношении каждого из перечисленных микроорганизмов, с указанием количества выделенных штаммов и числа обследованных больных. Как следует из таблицы, количество изученных микроорганизмов в ряде случаев превышает число больных, что связано с изменением чувствительности в процессе лечения. Данные представлены в абсолютных цифрах и в процентах к количеству изученных культур. Справа в верхней части таблицы представлена чувствительность одного из антибиотиков к конкретному микроорганизму (в данном случае Е. coli к амикацину) в динамике по месяцам.
Данный отчет исключает повтор одинаковой чувствительности для одних и тех же больных, что позволяет получать истинный уровень антибиотикорезистентности.
В графическом виде могут быть представлены сведения об уровне резистентности изученных микроорганизмов к любому выбранному антибактериальному препарату. Сведения можно получить как в процентах, так и в абсолютных числах — количество штаммов, резистентных, умеренно устойчивых и чувствительных.
Кроме того, для каждого антибактериального препарата легко проследить динамику резистентности любого выбранного микроорганизма как в графическом изображении, так и в виде гистограммы распределения по диаметрам зон или по МПК.
Из представленных гистограмм отчетливо видно, что резистентность St. epidermidis к оксациллину возрастает более интенсивно, чем к St. aureus.
г) Активность антибиотиков. Результат — упорядоченные по количеству чувствительных штаммов списки антибиотиков и микроорганизмов либо групп или подгрупп микроорганизмов, в отношении которых изучался каждый антибиотик за указанный период и в динамике по месяцам. Данный отчет исключает повтор для одних и тех же больных.
Активность антибиотиков представляется в табличном варианте в виде трехъярусной таблицы. В верхнем ярусе приводится список антибиотиков со сведениями о числе чувствительных, умеренно устойчивых и резистентных штаммов (в абсолютных цифрах и в процентах от числа исследованных) всех изученных микроорганизмов. Ниже (средний ярус) представлен список микроорганизмов с данными по чувствительности к отдельным антибиотикам. Одновременно приводятся данные по динамике активности одного из антибиотиков в отношении одного вида микроорганизмов либо рода, группы или подгруппы (нижний ярус таблицы).
В качестве выходных данных можно получить обобщенные сведения об активности всех или выбранных антибактериальных препаратов в отношении всех изученных микроорганизмов, а также выбранных отдельных видов или групп (подгрупп). Данные об активности препаратов в отношении всех изученных микроорганизмов необходимо учитывать при закупках антибактериальных препаратов, распределении их по отделениям и проведении своевременной ротации.
В данном разделе отчета предусмотрена возможность получения обобщенной справки «Уровень резистентности ведущей микрофлоры к антибактериальным препаратам». Такую справку можно получить как при полностью сформированных отчетах по заранее отобранным параметрам, так и при формировании только одного отчета «Активность антибиотиков».
В графическом варианте система обеспечивает получение сведений об активности любого выбранного антибактериального препарата в отношении всего спектра изученных культур или их части, а также динамику активности препарата по месяцам в отношении любого микроорганизма.
д) Состав ассоциаций. Результат — сведения о составе и количестве встречающихся сочетаний микроорганизмов в одном анализе в целом по стационару, по отделениям либо по биоматериалам или диагнозам за любой промежуток времени.
Данный отчет исключает повторные высевы одинаковых ассоциаций у одних и тех же больных.
е) Полирезистентные штаммы. К сожалению, в настоящее время в условиях клинических лабораторий не существует маркеров, подтверждающих идентичность штаммов микроорганизмов. Выявление же госпитальных штаммов, предотвращение их распространения и прерывание путей передачи является актуальной задачей. Поэтому нами в качестве маркера идентичности штаммов на данном уровне знаний выбран такой показатель, как «полирезистентность микроорганизмов к антибактериальным препаратам». Система осуществляет поиск штаммов микроорганизмов, резистентных к четырем и более антибактериальным препаратам при полной идентичности антибиотикограммы на остальные приведенные в анализе антибиотики.
Результат — список выбранных полирезистентных микроорганизмов с указанием для каждого из них количества и перечня антибиотиков, к которым данный микроорганизм устойчив.
Далее система осуществляет выбор больных, у которых выявлены полирезистентные штаммы.
Эпидемиолог или клинический микробиолог, анализируя полученные данные, делает заключение о наличии госпитальных штаммов и путях их передачи.
При появлении других маркеров идентичности штаммов микроорганизмов система способна осуществлять поиск и по ним.
- Читать далее "Пакеты программ для микробиологических лабораторий"
Редактор: Искандер Милевски. Дата публикации: 7.09.2019
- Определение степени микробной обсемененности различных биоматериалов
- Система регистрации и анализа в работе микробиологических лабораторий
- Бланк-заключение результата исследования биоматериала
- Статистический анализ результатов исследования биоматериала
- Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
- Пакеты программ для микробиологических лабораторий