Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала

Для химиотерапевтов, клиницистов и эпидемиологов наиболее важное значение имеют данные, получаемые при проведении эпидемиологического анализа.

Эпидемиологический раздел программы предназначен для постоянного мониторирования микрофлоры, вызывающей воспалительные и гнойно-септические заболевания и осложнения, слежения за уровнем резистентности выделенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам, а также для выявления штаммов, подозрительных на госпитальные, с использованием для их поиска признака полирезистентности к антибактериальным препаратам.

Данный раздел программы предусматривает проведение анализа и обработки той же базы данных, что и при составлении статистического отчета, и включает следующие разделы:
— спектр микроорганизмов
— чувствительность микроорганизмов
— активность антибиотиков
— состав ассоциаций
— полирезистентные штаммы.

Расчет показателей при проведении эпидемиологического анализа отличается от статистического отчета рядом особенностей. Так, в разделе «Спектр микроорганизмов» исключаются одинаковые микроорганизмы, выделенные от одного больного при повторных исследованиях, в разделе «Состав ассоциаций» — повторные высевы одинаковых по составу ассоциаций у одних и тех же больных, в разделах «Чувствительность микроорганизмов» и «Активность антибиотиков» — одинаковые по чувствительности одноименные микроорганизмы у одного больного при повторных исследованиях.

Кроме того, при проведении эпидемиологического анализа предусматривается возможность отбора анализов, удовлетворяющих данным таблиц при расчете всех показателей. Например, в разделе «Спектр микроорганизмов» можно выбрать списки больных (с указанием номера анализа, Ф. И. О. даты поступления материала на исследование, отделения, биоматериала, диагноза), у которых выделены интересующие пользователя микроорганизмы. Отобранный список появляется в нижней части соответствующего эпидемиологического отчета. Он может содержать большее число отобранных анализов по сравнению с соответствующим количественным показателем таблицы, так как для большей достоверности данных список включает исследования с повторными высевами одноименных микроорганизмов у одних и тех же больных.

а) Спектр микроорганизмов. Спектр микроорганизмов — это упорядоченный по частоте встречаемости (в абсолютных цифрах и в процентах по отношению ко всем выделенным) список микроорганизмов, выделенных в целом по стационару или выбранных отделениях, диагнозах, биоматериалах за весь или за указанный период, т. е. исходя из параметров, заложенных в отчетах. Спектр микроорганизмов представляется за весь указанный период и в динамике по месяцам в пределах выбранного периода.

Отчет представлен в виде таблицы, в левой части которой помещены названия микроорганизмов с количеством выделенных штаммов за отчетный период, в правой — динамика выделения каждого микроорганизма по месяцам.

В данном отчете, в отличие от статистического отчета «Микроорганизмы», в число культур не вошли одноименные микроорганизмы, полученные от одного и того же больного при повторных высевах.

Так, в приведенных выше данных статистического отчета количество выделенных микроорганизмов составляет 2412, а при анализе спектра выделенных микроорганизмов в эпидемиологическом отчете — 2189. Подчеркиваем, что исключение повторных высевов одних и тех же микроорганизмов от одного больного позволяет получать истинные данные о ведущей флоре. Выходные данные в данном разделе отчета пользователь может получать на любом уровне классификации микроорганизмов (вид, род, группа микроорганизмов).

Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Форма эпидемиологического отчета по спектру выделенных микроорганизмов
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Показатели ведущей микрофлоры

Сведения по ведущей микрофлоре (8-16 наиболее часто встречающихся микроорганизмов, составляющих от 70 до 90% от всех выделенных) можно получить в графическом варианте.

В графическом варианте можно представить и динамику ведущей микрофлоры за любой выбранный период времени.

Сведения о ведущей микрофлоре уникальны не только для каждого региона, стационара, но и для каждого отделения в пределах одного лечебного учреждения.

б) Чувствительность микроорганизмов. Результат — упорядоченный по количеству чувствительных штаммов (в абсолютных цифрах и в процентах к числу исследованных культур) список антибиотиков для каждого микроорганизма либо групп или подгрупп микроорганизмов в целом за указанный период и в динамике по месяцам.

Результат — данные по чувствительности микроорганизмов каждого вида (рода, группы или подгруппы) из спектра в абсолютных цифрах и в процентах к количеству исследованных культур (S, I и R штаммов) к различным антибиотикам, перечень которых для каждого наименования упорядочен по числу чувствительных штаммов, в целом за указанный период и в динамике по месяцам.

Отчет представлен в виде таблицы, в левой части которой даны названия микроорганизмов, в правой — перечень антибиотиков, изученных в отношении каждого из перечисленных микроорганизмов, с указанием количества выделенных штаммов и числа обследованных больных. Как следует из таблицы, количество изученных микроорганизмов в ряде случаев превышает число больных, что связано с изменением чувствительности в процессе лечения. Данные представлены в абсолютных цифрах и в процентах к количеству изученных культур. Справа в верхней части таблицы представлена чувствительность одного из антибиотиков к конкретному микроорганизму (в данном случае Е. coli к амикацину) в динамике по месяцам.

Данный отчет исключает повтор одинаковой чувствительности для одних и тех же больных, что позволяет получать истинный уровень антибиотикорезистентности.

В графическом виде могут быть представлены сведения об уровне резистентности изученных микроорганизмов к любому выбранному антибактериальному препарату. Сведения можно получить как в процентах, так и в абсолютных числах — количество штаммов, резистентных, умеренно устойчивых и чувствительных.

Кроме того, для каждого антибактериального препарата легко проследить динамику резистентности любого выбранного микроорганизма как в графическом изображении, так и в виде гистограммы распределения по диаметрам зон или по МПК.

Из представленных гистограмм отчетливо видно, что резистентность St. epidermidis к оксациллину возрастает более интенсивно, чем к St. aureus.

Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Форма эпидемиологического отчета об определении чувствительности микроорганизмов
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Показатели чувствительности микроорганизма (в процентах)
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Показатели чувствительности микроорганизма в абсолютных числах — количество штаммов
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Гистограмма распределения St. epidermidis по диаметрам зон задержки роста в присутствии оксациллина
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Гистограмма распределения St. aureus по диаметрам зон задержки роста в присутствии оксациллина

г) Активность антибиотиков. Результат — упорядоченные по количеству чувствительных штаммов списки антибиотиков и микроорганизмов либо групп или подгрупп микроорганизмов, в отношении которых изучался каждый антибиотик за указанный период и в динамике по месяцам. Данный отчет исключает повтор для одних и тех же больных.

Активность антибиотиков представляется в табличном варианте в виде трехъярусной таблицы. В верхнем ярусе приводится список антибиотиков со сведениями о числе чувствительных, умеренно устойчивых и резистентных штаммов (в абсолютных цифрах и в процентах от числа исследованных) всех изученных микроорганизмов. Ниже (средний ярус) представлен список микроорганизмов с данными по чувствительности к отдельным антибиотикам. Одновременно приводятся данные по динамике активности одного из антибиотиков в отношении одного вида микроорганизмов либо рода, группы или подгруппы (нижний ярус таблицы).

В качестве выходных данных можно получить обобщенные сведения об активности всех или выбранных антибактериальных препаратов в отношении всех изученных микроорганизмов, а также выбранных отдельных видов или групп (подгрупп). Данные об активности препаратов в отношении всех изученных микроорганизмов необходимо учитывать при закупках антибактериальных препаратов, распределении их по отделениям и проведении своевременной ротации.

В данном разделе отчета предусмотрена возможность получения обобщенной справки «Уровень резистентности ведущей микрофлоры к антибактериальным препаратам». Такую справку можно получить как при полностью сформированных отчетах по заранее отобранным параметрам, так и при формировании только одного отчета «Активность антибиотиков».

В графическом варианте система обеспечивает получение сведений об активности любого выбранного антибактериального препарата в отношении всего спектра изученных культур или их части, а также динамику активности препарата по месяцам в отношении любого микроорганизма.

Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Форма эпидемиологического отчета об определении активности антибиотиков
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Показатели активности антибиотика

д) Состав ассоциаций. Результат — сведения о составе и количестве встречающихся сочетаний микроорганизмов в одном анализе в целом по стационару, по отделениям либо по биоматериалам или диагнозам за любой промежуток времени.

Данный отчет исключает повторные высевы одинаковых ассоциаций у одних и тех же больных.

Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Форма эпидемиологического отчета о составе ассоциаций

е) Полирезистентные штаммы. К сожалению, в настоящее время в условиях клинических лабораторий не существует маркеров, подтверждающих идентичность штаммов микроорганизмов. Выявление же госпитальных штаммов, предотвращение их распространения и прерывание путей передачи является актуальной задачей. Поэтому нами в качестве маркера идентичности штаммов на данном уровне знаний выбран такой показатель, как «полирезистентность микроорганизмов к антибактериальным препаратам». Система осуществляет поиск штаммов микроорганизмов, резистентных к четырем и более антибактериальным препаратам при полной идентичности антибиотикограммы на остальные приведенные в анализе антибиотики.

Результат — список выбранных полирезистентных микроорганизмов с указанием для каждого из них количества и перечня антибиотиков, к которым данный микроорганизм устойчив.

Далее система осуществляет выбор больных, у которых выявлены полирезистентные штаммы.

Эпидемиолог или клинический микробиолог, анализируя полученные данные, делает заключение о наличии госпитальных штаммов и путях их передачи.

При появлении других маркеров идентичности штаммов микроорганизмов система способна осуществлять поиск и по ним.

Эпидемиологический отчет исследования результатов биоматериала
Список полирезистентных штаммов

- Читать далее "Пакеты программ для микробиологических лабораторий"

Редактор: Искандер Милевски. Дата публикации: 7.09.2019

Остались вопросы или замечания?

Все размещенные статьи преследуют образовательную цель и предназначены для лиц имеющих базовые знания в области медицины.
Без консультации лечащего врача нельзя применять на практике любой изложенный в статье факт.
Жалобы и возникшие вопросы просим присылать на адрес statii@dommedika.com
На этот же адрес ждем запросы на координаты авторов статей - быстро их предоставим.