Советуем для ознакомления:

Разделы генетики:

Популярные разделы сайта:

Оглавление темы "Методы анализа структуры ДНК. Геном человека.":
1. ПЦР. Полимеразная цепная реакция.
2. Методы анализа структуры ДНК. Секвенирование ДНК. Сиквенс ДНК.
3. Геном человека. Создание генетической карты генома человека.
4. Создание физической карты генома. Котиги.
5. Сиквенс генома человека. Стратегия сиквенса генома человека. Фингерпринт клона.
6. Особенности организации генома человека. Паразитические повторы ДНК.

Создание физической карты генома. Котиги.

Для того чтобы создать физическую карту генома, клонированные фрагменты генома человека также необходимо было маркировать.

Создание физической карты генома сделано с помощью коротких сиквенсов в 100—200 п.н. концов фрагментов (последовательность из 18—20 нуклеотидов уже является уникальной для генома), так называемых STS (sequence tagged sites), хромосомная локализация которых точно известна.

Создание физической карты генома. Котиги.
Рис. 7.6. Использование STS как маркеров перекрывания фрагментов ДНК при построении физической карты. Вверху показаны фрагменты ДНК из геномной библиотеки, в которых найдены специфические STS, внизу — взаимное расположение фрагментов ДНК, определенное по расположению STS.

STS легко идентифицируются с помощью ПЦР. Получено более 50 000 STS, разбросанных по геному, и во время физического картирования, когда устанавливается взаимное расположение ДНК фрагментов из геномных библиотек, эти STS используют как маркеры перекрывающихся сегментов ДНК (рис. 7.6). Из рис. 7.6 видно, что из перекрывающихся фрагментов ДНК, которые до этого могли быть клонированы в составе бактериальных, фаговых или дрожжевых искусственных хромосом, можно построить достаточно протяженные отрезки ДНК.

Последние называют контигами. В свою очередь из контигов можно построить физическую карту хромосомы.

- Читать далее "Сиквенс генома человека. Стратегия сиквенса генома человека. Фингерпринт клона."