Для того чтобы создать физическую карту генома, клонированные фрагменты генома человека также необходимо было маркировать.

Создание физической карты генома сделано с помощью коротких сиквенсов в 100—200 п.н. концов фрагментов (последовательность из 18—20 нуклеотидов уже является уникальной для генома), так называемых STS (sequence tagged sites), хромосомная локализация которых точно известна.

STS легко идентифицируются с помощью ПЦР. Получено более 50 000 STS, разбросанных по геному, и во время физического картирования, когда устанавливается взаимное расположение ДНК фрагментов из геномных библиотек, эти STS используют как маркеры перекрывающихся сегментов ДНК (рис. 7.6). Из рис. 7.6 видно, что из перекрывающихся фрагментов ДНК, которые до этого могли быть клонированы в составе бактериальных, фаговых или дрожжевых искусственных хромосом, можно построить достаточно протяженные отрезки ДНК.

Последние называют контигами. В свою очередь из контигов можно построить физическую карту хромосомы.

- Читать далее "Сиквенс генома человека. Стратегия сиквенса генома человека. Фингерпринт клона."